Bendíceme, Ultima está ambientada en el Nuevo México rural de los años cuarenta. Cuenta la historia de Antonio Marez, un joven de ascendencia mexicano-americana que alcanza la mayoría de edad en una pequeña comunidad agrícola. Ultima, la curandera local y guía espiritual, le ayuda en su transición a la edad adulta.
La novela comienza cuando Antonio, de seis años, es llevado a vivir con Ultima, curandera y sanadora. Ultima es anciana y sabia, y tiene una poderosa presencia en la comunidad. También es una guía espiritual que enseña a Antonio los misterios de la vida y la muerte.
Antonio es un niño precoz y está ansioso por aprender de Ultima y observar sus prácticas curativas. También llega a conocer a la gente de la comunidad, incluido el cura local, el padre Antonio, y los habitantes del pueblo. Durante este tiempo, Antonio empieza a comprender gradualmente el concepto de pecado y moralidad, así como el poder de la fe y la oración. También conoce las antiguas historias de la región, que hablan de las criaturas y fuerzas mágicas que habitan la tierra. Le fascina especialmente la leyenda de la carpa dorada, de la que se dice que concede deseos si se atrapa.
A medida que crece, Antonio empieza a enfrentarse a las exigencias contradictorias del mundo que le rodea. Dividido entre las creencias tradicionales de su familia y el mundo moderno del Oeste americano, se enfrenta a difíciles cuestiones sobre la fe y la moralidad.
Mientras tanto, Ultima se debilita gradualmente y pierde la capacidad de curarse. Antonio empieza a comprender que pronto fallecerá y debe encontrar la manera de aceptar su muerte.
La novela culmina con un fatídico enfrentamiento entre Antonio y un grupo de matones locales. En esta batalla, aprende el poder de sus convicciones y defiende aquello en lo que cree. Su valentía le ayuda a vencer a los matones y a ganarse el respeto de la gente del pueblo.
Al final de la novela, Ultima fallece y Antonio tiene que asimilar su muerte y tomar sus propias decisiones en la vida. Se da cuenta de que debe encontrar su camino y ser fiel a sí mismo y a sus seres queridos.
